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一種Argonaute介導(dǎo)的無引物指數(shù)擴(kuò)增方法及其應(yīng)用

文檔序號:42290545發(fā)布日期:2025-06-27 18:22閱讀:6來源:國知局

本發(fā)明涉及生物,具體涉及一種argonaute介導(dǎo)的無引物指數(shù)擴(kuò)增方法及其應(yīng)用。


背景技術(shù):

1、核酸擴(kuò)增技術(shù)作為分子診斷、基因測序及合成生物學(xué)等領(lǐng)域的核心技術(shù),其發(fā)展歷程始終圍繞如何高效、特異性地擴(kuò)增靶標(biāo)序列展開。傳統(tǒng)技術(shù)如聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(pcr)、環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增(lamp)以及重組酶聚合酶擴(kuò)增(rpa)等,雖然在特定場景中展現(xiàn)了實用性,但其核心依賴引物介導(dǎo)的靶標(biāo)識別機(jī)制,導(dǎo)致了一系列難以克服的技術(shù)瓶頸。

2、以pcr技術(shù)為例,其通過高溫變性(95℃)、低溫退火(50–65℃)和中溫延伸(72?℃)的三步循環(huán)實現(xiàn)dna擴(kuò)增,這一過程高度依賴一對特異性引物(通常為18–25?nt)。引物設(shè)計需通過blast工具驗證序列特異性,并嚴(yán)格控制gc含量(40–60?%)以避免二級結(jié)構(gòu)或引物二聚體的形成。然而,引物設(shè)計周期長、錯誤率高,且低豐度靶標(biāo)的擴(kuò)增效率顯著下降。此外,pcr對精密溫控設(shè)備的依賴限制了其在即時檢測(poct)中的應(yīng)用。在covid-19核酸檢測中,盡管pcr被廣泛采用,但病毒基因組的快速變異常導(dǎo)致引物脫靶,迫使設(shè)計頻繁更新,凸顯了引物依賴性技術(shù)的脆弱性。

3、相較于pcr的多溫階循環(huán),lamp技術(shù)通過鏈置換型dna聚合酶(如bst酶)在恒溫條件(60–65?℃)下實現(xiàn)擴(kuò)增,其核心在于利用4–6條引物(包括內(nèi)引物、外引物及環(huán)引物)識別靶標(biāo)的6–8個區(qū)域,形成環(huán)狀擴(kuò)增產(chǎn)物。然而,lamp的引物設(shè)計復(fù)雜度更高:內(nèi)引物需包含反向互補(bǔ)序列,極易形成二級結(jié)構(gòu),且依賴專用軟件(如primer?explorer)的設(shè)計容錯率較低(錯配容忍度<2?nt)。實際應(yīng)用中,引物間交叉反應(yīng)導(dǎo)致的非特異性擴(kuò)增及多重檢測時的信號干擾嚴(yán)重限制了其可靠性。例如,在瘧疾流行區(qū),lamp雖被用于瘧原蟲18s?rrna基因的檢測,卻因引物設(shè)計難以區(qū)分近緣物種而頻現(xiàn)誤判。

4、rpa技術(shù)則另辟蹊徑,利用重組酶(如t4?uvsx)與長引物(>30?nt)形成復(fù)合物,在恒溫(37-42?℃)下侵入雙鏈dna并啟動擴(kuò)增。該技術(shù)通過重組酶的鏈交換活性實現(xiàn)靶標(biāo)識別,避免了傳統(tǒng)熱循環(huán)需求。然而,長引物的合成成本高昂(需化學(xué)修飾及hplc純化),且高gc含量易導(dǎo)致重組酶活性喪失。此外,rpa的靈敏度受限于重組酶的熱敏感性,非特異性結(jié)合引發(fā)的背景信號(信噪比<2)亦需熒光探針輔助判讀。在埃博拉病毒野外檢測中,rpa雖因設(shè)備簡易受到青睞,卻因引物無法快速適配病毒變異而暴露局限性。

5、綜上,傳統(tǒng)技術(shù)的共性缺陷集中于引物依賴性帶來的設(shè)計復(fù)雜性、設(shè)備依賴性與靈敏度限制。pcr的多溫階需求、lamp的多引物設(shè)計負(fù)擔(dān)及rpa的長引物合成成本,均凸顯了引物作為“分子鑰匙”的雙刃劍效應(yīng)——既是靶標(biāo)識別的核心工具,亦是技術(shù)優(yōu)化的主要瓶頸。此外,引物二聚體、非特異性擴(kuò)增及低豐度靶標(biāo)檢測效率低下等問題,進(jìn)一步制約了這些技術(shù)在精準(zhǔn)醫(yī)療和現(xiàn)場檢測中的應(yīng)用。在此背景下,開發(fā)一種無需引物設(shè)計、兼具高靈敏度與特異性的核酸擴(kuò)增技術(shù),成為突破現(xiàn)有困局的關(guān)鍵方向。

6、ttago(thermus?thermophilus?argonaute)是一種源自革蘭氏陰性嗜熱菌的原核argonaute蛋白,其通過5'磷酸化單鏈引導(dǎo)dna(guide?dna,?gdna)的精準(zhǔn)導(dǎo)向,可在65-85℃高溫條件下實現(xiàn)dna引導(dǎo)的特異性核酸剪切功能。與crispr/cas系統(tǒng)相比,ttago展現(xiàn)出顯著的技術(shù)優(yōu)勢:其一,其作用機(jī)制不受原間隔序列鄰近基序(pam)限制,能夠靶向任意dna序列,而crispr/cas系統(tǒng)需依賴特定pam序列的識別;其二,ttago具備單堿基分辨率的精準(zhǔn)識別能力,對突變位點的空間位置無嚴(yán)格限制,而crispr/cas系統(tǒng)對pam鄰近區(qū)域的堿基錯配高度敏感,極大限制了其在突變檢測中的應(yīng)用范圍;其三,ttago可同時兼容多種gdna引導(dǎo)序列,實現(xiàn)多元靶標(biāo)的并行檢測且無信號串?dāng)_,而部分crispr/cas系統(tǒng)在多靶標(biāo)檢測時易引發(fā)交叉反應(yīng);其四,ttago具有優(yōu)異的耐高溫特性,在65-85℃范圍內(nèi)維持高效切割活性,通過添加蛋白變性劑(如dtt)可進(jìn)一步優(yōu)化其在低溫環(huán)境(如55℃)下的剪切效率;其五,ttago僅需短鏈gdna(15-20?nt)作為引導(dǎo)分子,相較于crispr/cas系統(tǒng)依賴的長鏈rna引導(dǎo)序列(約100?nt),其制備成本更低且穩(wěn)定性顯著提升。


技術(shù)實現(xiàn)思路

1、本發(fā)明的目的是提供一種argonaute介導(dǎo)的無引物指數(shù)擴(kuò)增方法及其應(yīng)用。

2、第一方面,本發(fā)明要求保護(hù)一種argonaute介導(dǎo)的無引物指數(shù)擴(kuò)增方法。

3、本發(fā)明所要求保護(hù)的argonaute介導(dǎo)的無引物指數(shù)擴(kuò)增方法,可包括如下步驟:

4、(a1)根據(jù)靶標(biāo)序列設(shè)計并合成5'端經(jīng)磷酸化修飾的單鏈引導(dǎo)dna,記作gdna;所述gdna與所述靶標(biāo)序列中部分序列(此處所述部分序列為連續(xù)序列)反向互補(bǔ);

5、(a2)將具有切割活性的argonaute與(a1)中所得gdna進(jìn)行孵育,得到argonaute/gdna復(fù)合物;

6、(a3)將(a2)中所得argonaute/gdna復(fù)合物與所述靶標(biāo)序列混合,通過反應(yīng)所述argonaute完成對所述靶標(biāo)序列的特異性切割(如ttago的切割位點位于所述gdna的5'?端第10和11個堿基之間的磷酸二酯鍵),并且釋放出被切割單鏈位于切割位點5’端的部分;

7、(a4)向步驟(a3)所得反應(yīng)產(chǎn)物中加入單鏈模板、dna聚合酶、dntps和反應(yīng)緩沖液,得到反應(yīng)體系;

8、所述單鏈模板自5’端到3’端依次由如下三部分組成:

9、第一部分:所述ab鏈的反向互補(bǔ)序列(記作a'b'鏈);

10、第二部分:所述gdna中位于所述切割位點5’端的核苷酸序列(記作c'鏈,若所述argonaute為ttago,則所述c'鏈為所述gdna的自5’端起第1-10位氨基酸序列);

11、第三部分:所述ab鏈的反向互補(bǔ)序列(即所述a'b'鏈)。

12、其中,所述第二部分(即所述c'鏈)和所述第三部分(即靠近3’端的所述a'b'鏈)組成的片段上具有與所述gdna完全相同的序列,所以在后續(xù)的擴(kuò)增反應(yīng)中,由所述單鏈模板生成的新雙鏈能重復(fù)被所述argonaute/gdna復(fù)合物特異性識別并剪切。

13、將所述反應(yīng)體系進(jìn)行反應(yīng),實現(xiàn)產(chǎn)物的指數(shù)擴(kuò)增。

14、在步驟(a4)中,所述ab鏈與所述單鏈模板中的a'b'鏈互補(bǔ)配對,在所述dna聚合酶的作用下延伸形成新雙鏈,所述新雙鏈重復(fù)被所述argonaute/gdna復(fù)合物特異性識別并剪切,釋放出的所述ab鏈、cab鏈(即由所述c'鏈和所述a'b'鏈順次連接后所得序列的反向互補(bǔ)序列)可重新進(jìn)入與所述單鏈模板互補(bǔ)配對,在所述dna聚合酶的作用下延伸形成新雙鏈,自此形成閉合循環(huán)動態(tài)過程,實現(xiàn)擴(kuò)增產(chǎn)物(即所述ab鏈和所述cab鏈)的指數(shù)累積。

15、進(jìn)一步地,所述單鏈模板的3’端可修飾有c3?spacer等基團(tuán)。目的是封閉3’端,防止非特異性擴(kuò)增。

16、在本發(fā)明的一個實施案例中,步驟(a2)中,所述argonaute為ttago。

17、進(jìn)一步地,步驟(a4)中,所述dna聚合酶可為鏈置換聚合酶。

18、在本發(fā)明的一個實施案例中,所述鏈置換聚合酶為vent?dna聚合酶。

19、進(jìn)一步地,步驟(a2)中,所述孵育可為75℃孵育30min。

20、進(jìn)一步地,步驟(a3)中,所述反應(yīng)可為85℃孵育1h。

21、進(jìn)一步地,步驟(a4)中,所述反應(yīng)的條件可為:55℃?30?s,85℃?45?s,120次循環(huán)。

22、本發(fā)明所要求保護(hù)的argonaute介導(dǎo)的無引物指數(shù)擴(kuò)增方法,可包括如下步驟:

23、前文所述(a1);

24、前文所述(a2);以及

25、將前文所述(a3)和前文所述(a4)合并而成的如下步驟(a34):將(a2)中所得argonaute/gdna復(fù)合物與所述靶標(biāo)序列、所述單鏈模板、所述dna聚合酶、所述dntps和所述反應(yīng)緩沖液混合,得到反應(yīng)體系,將所述反應(yīng)體系進(jìn)行反應(yīng),實現(xiàn)產(chǎn)物的指數(shù)擴(kuò)增。

26、進(jìn)一步地,在步驟(a34)中,所述反應(yīng)的條件為:55℃?30?s,85℃?45?s,120次循環(huán)。

27、所述靶標(biāo)序列既可為雙鏈,也可以為單鏈。所述靶標(biāo)序列的長度可為80-120?bp左右或80-120?nt左右。

28、在本發(fā)明的一個實施案例中所述靶標(biāo)序列為長度91?bp的雙鏈dna。所述靶標(biāo)序列具體為由seq?id?no.1所示正向鏈和seq?id?no.2所示反向鏈反向互補(bǔ)形成的雙鏈dna。相應(yīng)地,所述gdna的序列如seq?id?no.3所示(5’端經(jīng)磷酸化修飾)。所述ab鏈的序列如seq?idno.4所示。所述單鏈模板的序列如seq?id?no.7所示(3’端修飾有c3?spacer基團(tuán))。

29、在本發(fā)明的一個實施案例中,步驟(a2)中進(jìn)行所述孵育的體系中含有0.33μm的ttago和1.67μm?gdna,以及10mm的mg2+以及反應(yīng)緩沖液(如10×thermopol反應(yīng)緩沖液),余量為水。步驟(a3)的反應(yīng)體系是向上述步驟(a2)反應(yīng)后的體系中加入所述靶標(biāo)序列和反應(yīng)緩沖液(如10×thermopol反應(yīng)緩沖液)以及水后所得,其中上述步驟(a2)反應(yīng)后的體系占6/10的體積比,所述靶標(biāo)序列的濃度為100nm。步驟(a4)的反應(yīng)體系是向上述步驟(a3)反應(yīng)后的體系中加入所述單鏈模板、所述dna聚合酶、所述dntps、所述反應(yīng)緩沖液(如10×thermopol反應(yīng)緩沖液)、sybr?green?i以及水后所得,其中,所述單鏈模板的終濃度為0.1μm,所述dna聚合酶的終濃度為0.1u/μl,所述dntps的終濃度為0.25?mm,所述ttago的終濃度為0.1μm,所述gdna的終濃度為0.5μm。

30、在本發(fā)明的另一個實施案例中,步驟(a34)中的所述反應(yīng)體系是向上述步驟(a2)反應(yīng)后的體系中加入所述靶標(biāo)序列、所述單鏈模板、所述dna聚合酶、所述dntps、所述反應(yīng)緩沖液(如10×thermopol反應(yīng)緩沖液)、sybr?green?i以及水后所得,其中,所述靶標(biāo)序列的濃度為1nm,所述單鏈模板的終濃度為0.1μm,所述dna聚合酶的終濃度為0.1u/μl,所述dntps的終濃度為0.25?mm,所述ttago的終濃度為0.1μm,所述gdna的終濃度為0.5μm。

31、第二方面,本發(fā)明要求保護(hù)前文第一方面中所述方法在檢測靶標(biāo)序列是否發(fā)生突變中的應(yīng)用。

32、進(jìn)一步地,所述突變可為單堿基或多堿基的插入或缺失或替換;所述多堿基為兩個以上(含兩個)堿基。

33、第三方面,本發(fā)明要求保護(hù)一種檢測待測靶標(biāo)序列是否發(fā)生特定突變的方法。

34、本發(fā)明要求保護(hù)的檢測待測靶標(biāo)序列是否發(fā)生特定突變的方法,可包括如下步驟:

35、(b1)根據(jù)發(fā)生特定突變的突變后靶標(biāo)序列設(shè)計并合成5'端經(jīng)磷酸化修飾的單鏈引導(dǎo)dna,記作gdna;所述gdna與所述突變后靶標(biāo)序列中的部分序列(此處所述部分序列為連續(xù)序列)反向互補(bǔ);所述部分序列包括所述特定突變位置處的核苷酸;

36、(b2)將具有切割活性的argonaute與(b1)中所得gdna進(jìn)行孵育,得到argonaute/gdna復(fù)合物;

37、(b3)將(b2)中所得argonaute/gdna復(fù)合物與待測靶標(biāo)序列混合,在特定溫度下進(jìn)行孵育;所述特定溫度為所述argonaute能夠發(fā)揮切割活性的溫度;

38、(b4)向步驟(b3)處理后的體系中加入單鏈模板、dna聚合酶、dntps和反應(yīng)緩沖液,得到反應(yīng)體系;

39、所述單鏈模板自5’端到3’端依次由如下三部分組成:

40、第一部分:ab鏈的反向互補(bǔ)序列(記作a'b'鏈);所述ab鏈為(b2)中所得argonaute/gdna復(fù)合物特異性切割所述突變后靶標(biāo)序列(ttago的切割位點位于所述gdna的5'?端第10和11個堿基之間的磷酸二酯鍵)被切割單鏈位于切割位點5’端的部分;

41、第二部分:所述gdna中位于所述切割位點5’端的核苷酸序列(記作c'鏈,若所述argonaute為ttago,則所述c'鏈為所述gdna的自5’端起第1-10位氨基酸序列);

42、第三部分:所述ab鏈的反向互補(bǔ)序列(即所述a'b'鏈)。

43、其中,所述第二部分(即所述c'鏈)和所述第三部分(即靠近3’端的所述a'b'鏈)組成的片段上具有與所述gdna完全相同的序列。

44、將所述反應(yīng)體系進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng);反應(yīng)過程中監(jiān)測是否發(fā)生產(chǎn)物的指數(shù)擴(kuò)增,然后按照如下確定所述待測靶標(biāo)序列是否發(fā)生了所述特定突變:若發(fā)生產(chǎn)物的指數(shù)擴(kuò)增,則所述待測靶標(biāo)序列發(fā)生或候選發(fā)生了所述特定突變,若未發(fā)生產(chǎn)物的指數(shù)擴(kuò)增,則所述待測靶標(biāo)序列未發(fā)生或候選未發(fā)生所述特定突變。

45、在該方法中,由于ttago具有單堿基分辨率(即ttago對gdna與靶標(biāo)序列的互補(bǔ)配對要求極高,僅當(dāng)兩者完全匹配時才能激活切割活性。單個堿基錯配會導(dǎo)致切割效率顯著下降甚至完全失效),因此:若所述待測靶標(biāo)序列發(fā)生了所述特定突變,則根據(jù)所述突變后靶標(biāo)序列設(shè)計的gdna與ttago形成復(fù)合物后,其能夠特異性識別并切割所述突變后靶標(biāo)序列,進(jìn)而實現(xiàn)后續(xù)的產(chǎn)物指數(shù)擴(kuò)增;而對于未發(fā)生所述特定突變的序列則不能有效識別和切割,最終致使整個過程無法實現(xiàn)產(chǎn)物的指數(shù)累積。

46、進(jìn)一步地,所述單鏈模板的3’端可修飾有c3?spacer等基團(tuán)。目的是封閉3’端,防止非特異性擴(kuò)增。

47、在本發(fā)明的一個實施案例中,步驟(b2)中,所述argonaute為ttago。

48、進(jìn)一步地,步驟(b4)中,所述dna聚合酶可為鏈置換聚合酶。

49、在本發(fā)明的一個實施案例中,所述鏈置換聚合酶為vent?dna聚合酶。

50、進(jìn)一步地,步驟(b2)中,所述孵育可為75℃孵育30min。

51、進(jìn)一步地,步驟(b3)中,所述反應(yīng)可為85℃孵育1h。

52、進(jìn)一步地,步驟(b4)中,所述反應(yīng)的條件可為:55℃?30?s,85℃?45?s,120次循環(huán)。

53、本發(fā)明要求保護(hù)的檢測待測靶標(biāo)序列是否發(fā)生特定突變的方法,可包括如下步驟:

54、前文所述(b1);

55、前文所述(b2);以及

56、將前文所述(b3)和前文所述(b4)合并而成的如下步驟(b34):將(b2)中所得argonaute/gdna復(fù)合物與所述待測靶標(biāo)序列、所述單鏈模板、所述dna聚合酶、所述dntps和所述反應(yīng)緩沖液混合,得到反應(yīng)體系,將所述反應(yīng)體系進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng);反應(yīng)過程中監(jiān)測是否發(fā)生產(chǎn)物的指數(shù)擴(kuò)增,然后按照如下確定所述待測靶標(biāo)序列是否發(fā)生了所述特定突變:若發(fā)生產(chǎn)物的指數(shù)擴(kuò)增,則所述待測靶標(biāo)序列發(fā)生或候選發(fā)生了所述特定突變,若未發(fā)生產(chǎn)物的指數(shù)擴(kuò)增,則所述待測靶標(biāo)序列未發(fā)生或候選未發(fā)生所述特定突變。

57、進(jìn)一步地,在步驟(b34)中,所述擴(kuò)增反應(yīng)的條件為:55℃?30?s,85℃?45?s,120次循環(huán)。

58、進(jìn)一步地,步驟(b4)和步驟(b34)中,所述監(jiān)測是否發(fā)生產(chǎn)物的指數(shù)擴(kuò)增可通過如下實現(xiàn):進(jìn)行反應(yīng)前向所述反應(yīng)體系中同時加入熒光染料;

59、進(jìn)一步地,所述熒光染料為sybr?green?i。

60、進(jìn)一步地,所述靶標(biāo)序列既可為雙鏈,也可以為單鏈。所述靶標(biāo)序列的長度可為80-120?bp或80-120?nt。

61、在本發(fā)明的一個實施案例中所述靶標(biāo)序列為長度91?bp的雙鏈dna。所述靶標(biāo)序列具體為由seq?id?no.1所示正向鏈和seq?id?no.2所示反向鏈反向互補(bǔ)形成的雙鏈dna。相應(yīng)地,所述gdna的序列如seq?id?no.3所示(5’端經(jīng)磷酸化修飾)。所述ab鏈的序列如seq?idno.4所示。所述單鏈模板的序列如seq?id?no.7所示(3’端修飾有c3?spacer基團(tuán))。

62、進(jìn)一步地,所述gdna的長度為16-25nt。在本發(fā)明的一個實施案例中,所述gdna的長度為17nt。

63、進(jìn)一步地,所述ab鏈的長度為15-19nt。在本發(fā)明的一個實施案例中,所述ab鏈的長度為19nt。

64、在本發(fā)明的一個實施案例中,步驟(b2)中進(jìn)行所述孵育的體系中含有0.33μm的ttago和1.67μm?gdna,以及10mm的mg2+以及反應(yīng)緩沖液(如10×thermopol反應(yīng)緩沖液),余量為水。步驟(b3)的反應(yīng)體系是向上述步驟(b2)反應(yīng)后的體系中加入所述靶標(biāo)序列和反應(yīng)緩沖液(如10×thermopol反應(yīng)緩沖液)以及水后所得,其中上述步驟(b2)反應(yīng)后的體系占6/10的體積比,所述靶標(biāo)序列的濃度為100nm。步驟(b4)的反應(yīng)體系是向上述步驟(b3)反應(yīng)后的體系中加入所述單鏈模板、所述dna聚合酶、所述dntps、所述反應(yīng)緩沖液(如10×thermopol反應(yīng)緩沖液)、sybr?green?i以及水后所得,其中,所述單鏈模板的終濃度為0.1μm,所述dna聚合酶的終濃度為0.1u/μl,所述dntps的終濃度為0.25?mm,所述ttago的終濃度為0.1μm,所述gdna的終濃度為0.5μm。

65、在本發(fā)明的另一個實施案例中,步驟(b34)中的所述反應(yīng)體系是向上述步驟(b2)反應(yīng)后的體系中加入所述靶標(biāo)序列、所述單鏈模板、所述dna聚合酶、所述dntps、所述反應(yīng)緩沖液(如10×thermopol反應(yīng)緩沖液)、sybr?green?i以及水后所得,其中,所述靶標(biāo)序列的濃度為1nm,所述單鏈模板的終濃度為0.1μm,所述dna聚合酶的終濃度為0.1u/μl,所述dntps的終濃度為0.25?mm,所述ttago的終濃度為0.1μm,所述gdna的終濃度為0.5μm。

66、第四方面,本發(fā)明要求保護(hù)如下任一試劑盒:

67、(c1)一種用于進(jìn)行argonaute介導(dǎo)的無引物指數(shù)擴(kuò)增的試劑盒,含有前文第一方面中所述的gdna、所述的argonaute、所述的單鏈模板和所述的dna聚合酶。

68、(c2)一種用于檢測待測靶標(biāo)序列是否發(fā)生特定突變的試劑盒,含有前文第三方面中所述的gdna、所述的argonaute、所述的單鏈模板、所述的dna聚合酶和所述的熒光染料。

69、進(jìn)一步地,所述試劑盒中還可含有擴(kuò)增緩沖液和dntps。

70、實驗證明,本發(fā)明構(gòu)建了基于ttago蛋白的內(nèi)源引物驅(qū)動型擴(kuò)增體系:ttago/gdna復(fù)合物通過靶向剪切靶標(biāo)dna釋放初始的功能性內(nèi)源引物鏈;該引物與外源加入的單鏈模板互補(bǔ)引導(dǎo)聚合酶延伸生成雙鏈結(jié)構(gòu),熱循環(huán)(解鏈-退火-延伸)驅(qū)動擴(kuò)增產(chǎn)物累積的同時,觸發(fā)ttago對新生雙鏈的二次切割及引物再生,釋放的引物反饋至擴(kuò)增級聯(lián),形成剪切-延伸耦聯(lián)的自持性循環(huán)系統(tǒng)。sybr?green?i實時熒光定量分析證實,該體系實現(xiàn)了dna產(chǎn)物的指數(shù)合成。

71、本發(fā)明相比現(xiàn)有技術(shù),具有如下優(yōu)勢:(1)本發(fā)明徹底摒棄外源引物設(shè)計,內(nèi)源引物自動生成。利用ttago/gdna復(fù)合物直接識別并切割靶標(biāo)獲得引物,徹底消除引物設(shè)計、合成與驗證環(huán)節(jié)。(2)本發(fā)明零引物二聚體與非特異性風(fēng)險。ttago的靶向切割與vent?dna聚合酶的校正活性(3'→5'?exonuclease)協(xié)同作用形成雙重特異性保障。(3)本發(fā)明使用指數(shù)級自驅(qū)動擴(kuò)增,實現(xiàn)產(chǎn)物2n累積,擴(kuò)增效率穩(wěn)定;鏈置換高效解旋,vent?dna聚合酶持續(xù)合成能力克服模板二級結(jié)構(gòu),靈敏度提高。(4)本發(fā)明兼容snp、插入/缺失突變,無需重新設(shè)計引物。后續(xù)可以應(yīng)用于擴(kuò)增檢測試劑盒,避免假陽性,提高檢出率。

72、總之,本發(fā)明通過內(nèi)源引物自生成機(jī)制,解決了傳統(tǒng)技術(shù)中引物設(shè)計復(fù)雜、非特異性干擾嚴(yán)重等核心問題。argonaute蛋白與鏈置換聚合酶的協(xié)同作用,實現(xiàn)了無需引物的指數(shù)擴(kuò)增,為分子診斷、環(huán)境監(jiān)測及合成生物學(xué)提供了標(biāo)準(zhǔn)化、低成本的技術(shù)平臺。

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